台独的陈水扁利用反恐扯上反共。 台在野党：不符国际现实
陈水扁总统积极响应反恐同时，将反恐与反共划上等号，在野党立委评论一致认为扁政府此举对内宣传意味重，并有意藉妖魔化中共，脱卸三通不成责任，惟「反恐」等於「反共」的逻辑并不符国际政治对恐怖主义的认定，恐贻笑国际，并将对未来两岸关系发展更增障碍。
亲民党立委林郁芳指出，全世界只有陈总统会把反恐与反共扯在一起，实际美国副国务卿阿米塔吉八月访问北京即是与中共洽谈如何共同反恐，美国不但在对阿富汗、东土耳其等情报资讯□集上需要中共的协助，要求联合国支持攻反恐行动，更需中共在联合国内的奥援，陈总统响应美国反恐，却扯上反共，几乎可预期美国务院根本不会理会我方的说法。
林郁芳并批评将反恐与反共划等号的逻辑「可笑」，陈总统称中共构思对台施行「超限战」即属恐攻击的说法更难成立，林郁芳质疑美国也用电脑病毒等超限战争概念攻击敌人，甚至我军方也正在研发电脑病毒作战，依陈总统的逻辑，难道美国与我们自己也算正从事恐怖攻击行动？
无党籍立委陈文茜指出，陈总统将反恐等同反共，与国际政治对恐怖主义的定义有很大差异，尤其中共在操作上一面加入国际反恐行动，一面对内处理新疆独立问题，因此能成功获得国际社会的认可，目前世界各国也没有人将中共列入所谓邪恶轴心国，但我政府做法却与政治现实背道而驰，不但将中共视作恐怖组织，对北韩、伊拉克等邪恶轴心国反而不排斥。
陈文茜评估，台湾政府的诉求可能在国内确能发挥作用，并有助於民进党选举，民进党同时有意藉此举强化台湾民间与大陆的敌意，进而化解二００四年仍无法三通的困境，但此一逻辑可能引发企业西进算不算支持恐怖组织、叛国的争论，也无助於我国际能见度的推广，政府不如好好思考如何善用慈济、世界展望会等民间团体进行人道外交的可能性。
国民党立委陈学圣批评，扁政府此举目的在於「去中国化」，希望妖魔化中共以争取台湾更多自主空间，但政府需注意在过度仰赖美国、忽略和中共关系政策下，一旦美国与中共因反恐关系愈密，台湾又该如何自处？届时台湾的自主空间在哪里？他呼吁政府当务之急仍应在改善两岸关系，而非妖魔化中共。